2003年度

Nucleic Acids Research

310462
Enlarged FAMSBAS; Protein 3D structure models of genome sequences for 41 species
山口晶大* ; 岩舘満雄* ; 鈴木栄一郎* ; 由良敬 ; 川北重恒* ; 梅山秀明* ; 郷通子*
Nucleic Acids Research 31(1), p.463-468(2003) ; (JAERI-J 20028)

　拡大FAMSBASEは全ゲノムが判明している41生物種がもつすべてのタンパク質のホモロジーモデリング結果を格納したリレーショナルデータベースである．モデルはFAMSによって構築した．拡大FAMSBASEには各種の検索方法が備わっている； タンパク質名，キーワード，タンパク質と相互作用する低分子名，アミノ酸配列の一致度など．これらのモデルはタンパク質と他の分子との相互作用を研究するよい出発点となる．ドラッグデザインのもととしても利用可能である．現在本データベースには18万以上のタンパク質立体構造が格納されている．本データベースはhttp://famsbase.bio.nagoya-u.ac.jp/famsbase/から利用可能である．