330049
Molecular dynamics simulation studies of radiation damaged DNA molecules and repair enzymes
Pinak, M.
JAERI-1346; Dec.2004,25p.

　放射線により損傷をうけたDNAの分子レベルにおける経時的変化を調べるために，チミンダイマー，チミングリコール，8-オキソグアニンについて分子動力学シミュレーションを利用した研究を行った．すべてのケースでDNA二重らせん構造の重大な構造変化が観察された．それらは(1)相補的な塩基との水素結合ネットワークの破壊による二重らせんの分離(8-オキソグアニン)，(2)損傷部位を中心としたDNAの折れ曲り（チミンダイマー，チミングリコール），(3)相補鎖上の塩基のDNA外へのフリッピングアウト(8-オキソグアニン)に大別される．また，損傷部位において特異的な静電エネルギーとしてチミンダイマー：-10kcal/mol，チミングリコール：-26kcal/mol，8-オキソグアニン：-48kcal/molが観察された．