Posttranslational modification of the -encoded subunit of DNA polymerase V regulates its interactions with the processivity clamp

にコードされる大腸菌DNAポリメラーゼVサブユニットの翻訳後修飾はプロセッシィビィティ・クランプとの相互作用を調節する

Sutton, M. D.*; 鳴海 一成; Walker, G. C.*

Sutton, M. D.*; Narumi, Issei; Walker, G. C.*

大腸菌遺伝子産物(PolV)は、DNA損傷チェックポイント制御及び乗り越えDNA合成に関与している。2種類の遺伝子産物,UmuDとUmuD'蛋白質と、複製型DNAポリメラーゼ(PolIII)との相互作用の解析は、遺伝子産物がどんな生物学的役割を果たしているのかを調べるために重要である。われわれは、UmuD蛋白質がUmuD'蛋白質よりもPolIIIのクランプに対して高い親和性を有しており、この親和性にはUmuD'には欠けているUmuD蛋白質のアミノ酸N末端アーム部の存在が重要であることを示した。さらに、クランプと架橋剤-azidoiodoacetanilideによってクロスリンクする特定のアミノ酸残基を同定し、PolIIIとの相互作用に重要な蛋白質の構造部位を限定した。

The gene products (PolV) participate in both a DNA damage checkpoint control and translesion DNA synthesis. Interactions of the two gene products, UmuD and UmuD' proteins, with components of the replicative DNA polymerase (PolIII), are important for determining which biological role the gene products will play. We have shown that UmuD possesses a higher affinity for PolIII processivity clamp than does UmuD' because of the N-terminal arm of UmuD, much of which is missing in UmuD'. Futhermore, we identified specific amino acid residues of UmuD that crosslink to with a crosslinker, -azidoiodoacetanilide, defining the domain important for the interaction.