Electrostatic potential of nucleotide-free protein is sufficient for discrimination between adenine and guanine-specific binding sites

ヌクレオチド未結合のたんぱく質の静電ポテンシャルは結合部位のアデニンとグアニンの結合特異性を十分に識別できる

Basu, G.*; Sivanesan, D.*; 川端 猛*; 郷 信広

Basu, G.*; Sivanesan, D.*; Kawabata, Takeshi*; Go, Nobuhiro

非常に多くのたんぱく質が、機能発現のためにアデニンあるいはグアニンを結合する。これらのたんぱく質は、多くの共通の性質を持つにもかかわらず、しばしば明確にアデニンとグアニンを識別する。われわれはこの識別の物理化学的仕組みを解明するために、データベース中にあるこれらのたんぱく質について、それらのアデニン/グアニン結合部位の静電ポテンシャルを計算し、解析した。その結果、静電ポテンシャルのパターンだけで、たんぱく質のアデニン/グアニン識別能を判定できることを示すことができた。

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