Annual report of R&D activities in center for promotion of computational science and engineering and Center of Computational Science & e-Systems from April 1, 2005 to March 31, 2006

平成17年度システム計算科学センター研究開発年報

システム計算科学センター

Center for Computational Science & e-Systems

本報告書では、平成17年度4月1日9月30日までの期間における日本原子力研究所・計算科学技術推進センター(CCSE)と平成17年度10月1日3月31日までの日本原子力研究開発機構・システム計算科学センターにおける一年間(平成17年度)の研究開発活動について報告する。ITBLプロジェクトにおいては、ITBL基盤ソフトウエアと独グリッド環境の相互利用を可能としたほか、グリッド計算機環境で動作する大規模構造解析技術を実プラントデータで実証し、世界最大の高性能計算機科学国際会議Supercomputing(SC05)で"Honorable Mention"を受けた。一方、原子力分野における物質材料シミュレーションや、生体及びDNA損傷修復機構解明のためのシミュレーションでは、原子炉鋼材の10種以上の不純物に対する粒界脆化度の第一原理計算による定量的評価結果と超伝導中性子デバイスの中性子衝突後の非平衡ダイナミクスによる時空間分解能予測結果が示されたほか、生体分子動力学シミュレーションによるDNA複製修復タンパク質の機能解析が展開できた。また、これらの一連の研究を通して研鑽した並列計算技術は、上記国際会議SC05にてゴードンベル賞のファイナリストに選出された。

This report provides an overview of research and development activities in Center for Computational Science and Engineering (CCSE), JAERI in the former half of the fiscal year 2005 (April 1, 2005 - Sep. 30, 2006) and those in Center for Computational Science & e-Systems (CCSE), JAEA, in the latter half of the fiscal year 2005(Oct 1, 2005 - March 31, 2006). One of the main topics of CCSE in the fiscal year 2005 was verification by using structure analysis for real plant executable on the Grid environment. Our research paper on this issue received "honorable mention" in Supercomputing 2005. Other topics studied intensively in materials science and bioinformatics were as follows; a first-principle calculation to examine embrittlement effects of the grain boundaries for more than 10 impurity elements, a semi-first principle simulation to explore non-equilibrium superconducting dynamics after the neutron capture in neutron detector device using MgB2 superconductor, a molecular dynamics simulation of DNA replication/repair protein with DNA to analyze its atomic detail for realizing its function, and so on. The remarkable issue in these research activities was that large-scale simulation technique developments on the Earth Simulator was selected as "Gordon Bell Prize finalist" in the conference "Supercomputing (SC05)".