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Processing of clustered DNA damage site in ${it Escherichia coli}$

大腸菌におけるクラスターDNA損傷のプロセシング

鹿園 直哉; Pearson, P.*; Thacker, J.*; O'Neill, P.*

Shikazono, Naoya; Pearson, P.*; Thacker, J.*; O'Neill, P.*

ジヒドロチミンと8-オキソグアニンと呼ばれる塩基損傷からなるクラスター損傷のプロセシングに関する知見を得る目的から、大腸菌の野生株において、塩基損傷が除去された後生ずると考えられる修復中間体の形質転換効率及び変異誘発頻度を調べた。その結果、「ジヒドロチミンと脱塩基部位」もしくは「ジヒドロチミンと鎖切断」では変異頻度が高くないが、塩基損傷のない「脱塩基部位と脱塩基部位」もしくは「脱塩基部位と鎖切断」ではともに、形質転換効率は非常に低くかつ変異頻度は非常に高いことがわかった。これらの結果から、8-オキソグアニンもしくはジヒドロチミンのどちらかが除去された後に残ったクラスター損傷内の塩基損傷は、脱塩基部位や鎖切断には変換されないことが示唆された。

To gain insights on the processing of the DHT + 8-oxoG cluster in vivo, several potential intermediates after removal of base lesions were assessed for their transformation efficiency and mutability in the wild type strain of ${it Escherichia coli}$. DHT + AP or DHT + Gap containing cluster demonstrated relatively low mutation frequency. On the other hand, in the case of an AP + AP or Gap + AP cluster, in which a base damage is absent, transformation efficiencies were significantly reduced. From these results it is suggested that, when either 8-oxoG or DHT is initially excised from a cluster containing 8-oxoG and DHT, the modified base remaining within the resulting damage will not be converted into an AP site or to a single strand break in vivo.

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