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生体分子表面の水分子の滞在時間はどのようにして決まるのか

What determines the residence time of water molecules hydrating on biomolecules ?

米谷 佳晃; 河野 秀俊

Yonetani, Yoshiteru; Kono, Hidetoshi

生体分子表面は複雑であり、それゆえ水のダイナミクスは多様である。水分子の生体分子表面滞在時間は、数psから数100psまでさまざまであるが、その違いはどのようにして生じるのであろうか。筆者らは、さまざまな塩基配列を持つDNAを対象にした分子動力学シミュレーションから、DNAと水の水素結合様式とDNA表面の構造揺らぎが、水分子の滞在時間に関係していることを明らかにした。そこでは、Laage-Hynesにより示された水素結合組換えのメカニズムとの接点も明らかになった。今後、タンパク質の場合なども含め、水分子の滞在時間を統一的に理解し、表現していくためには、これまで示唆されてきた表面の形状と電気的性質の影響も考慮しなければならない。

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