ヒストンテールの構造とダイナミクス tailKono, Hidetoshi; Ikebe, Kimiyoshi
ヒストンテールは化学修飾のターゲットであり、エピゲノムのマーカーとしての重要性から多くの研究がなされている。立体構造の観点からヒストンテールを見ると、モノヌクレソームのX線結晶構造解析では結晶中での構造多形のため、構造を決定することができない。本研究では、計算機シミュレーションにより、ヌクレオソーム構造下でのヒストンテールの構造を探った。ヒストンテールは、正電荷をもつリジン,アルギニン残基を多く持つため、負電荷を持つDNAのリン酸骨格と強い静電相互作用で貼りつく。そのため、数
秒の分子動力学計算ではテールがとり得る構造を網羅的にサンプリングすることができない。そこで、我々は高効率に構造をサンプリングすることができる計算方法を開発し、ヌクレオソーム下でのテールの構造を求めている。現在までのサンプリング結果では、Hテールはほぼ常時リン酸骨格の表面に接触した状態にあり(水中に向かって伸びている構造は室温ではほとんどとらない)、構造アンサンブルの大半は特定の二次構造を持っていないが一部ヘリックス構造をとっていることがわかった。
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使用言語 |
: | Japanese |
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開催年月 |
: | 2013/11 |
開催都市 |
: | 箱根 |
開催国 |
: | 日本 |
キーワード |
: | no keyword |
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