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長沼 毅*; 今中 忠行*; 跡見 晴幸*; 村上 由記*; 岩月 輝希
JNC TY7400 2000-002, 37 Pages, 2000/05
JNC-TY7400-2000-002.pdf:1.17MB
近年地下には地表よりも大きいバイオマスが存在している可能性が示唆され、地下生物圏の存在が注目され始めている。これらの微生物は、深部地質環境における酸化・還元や溶解・沈澱に影響を与えている可能性がある。地下深部の微生物について基礎的な知見を得るため,岐阜県東濃地域において,微生物現存量や活性に関する調査研究を行った。地下水中の全菌数は、概ね107cells/ml(堆積岩層)
106cells/ml(花崗岩層)であり、全般的に堆積岩層で一桁高くなっていた。一方、微生物の種類(形態)および形態種数は深度ごとにかなり異なっていた。酸化還元状態との関連を見ると、花崗岩層の深度180330mの酸化還元電位はFe2+/Fe(OH)3の酸化還元境界に相当し、ここに鉄関連細菌生菌数のピークが見られ、深度500m以深の酸化還元電位はHS/SO42-の酸化還元境界にあたり、硫酸還元菌の存在しうる酸化還元電位があると想定される深度帯(深度300500m)に硫酸還元の存在が認められた。深部地質環境における微生物の存在量と活性は、地下の地球化学プロセスと密接な関係にあることが示唆された。
におけるDNA polymerase B遺伝子破壊株の特徴櫛田 卓志*; 鳴海 一成; 藤原 伸介*; 今中 忠行*; 東端 啓貴*
no journal, ,
の
遺伝子について解析を進める過程で、ポリメラーゼドメインの保存領域であるRegion2が欠失した株を見いだし、PolBが細胞の生育に必須ではないことを発見した。本研究では、においてPolBがDNA複製以外に果たす役割を解明することにより、アーキアのDNA複製機構に関し新たな知見を与えることを目的とした。今回、 遺伝子の完全破壊株の作製に成功した(
株)。この株について17時間培養した菌体にUV,メチルメタンスルホン酸,マイトマイシンC,
線といったDNA損傷ストレスを与えた後、プレート上で培養した。その結果、親株に比して株は、試みたすべてのDNA損傷ストレスに対し高い感受性を示すことが確認できた。この結果から、において遺伝子は必須遺伝子ではないが、DNA修復機構に深く関与していることが示唆された。
DNA PolB破壊株のDNA損傷ストレス感受性倉内 康行*; 櫛田 卓志*; 鳴海 一成; 藤原 伸介*; 今中 忠行*; 東端 啓貴*
no journal, ,
超好熱性アーキアにはファミリーB型のPolBとファミリーD型のPolDの2種類のDNAポリメラーゼが存在し、その両者がDNA複製において必須であると考えられてきた。しかし、われわれはこれまでに、のDNAポリメラーゼ遺伝子のうち遺伝子破壊株(株)の取得に成功し、PolBが細胞の生育に必須ではないことを見いだした。本研究では、対数増殖期(5時間培養)の株に対してDNA損傷ストレスを与えたところ、定常期の細胞に比して感受性の低下が見られた。対数増殖期に発現しているDNA修復関連酵素が PolBの機能を相補している可能性が示唆された。遺伝子が破壊されたことで変動する遺伝子群を調べることが今後の課題である。
のDNA polymerase Bは細胞の生育に必須ではない櫛田 卓志*; 倉内 康行*; 鳴海 一成; 藤原 伸介*; 今中 忠行*; 東端 啓貴*
no journal, ,
の遺伝子について解析を進める過程で、ポリメラーゼドメインの保存領域が欠失した変異株を取得し、PolBタンパク質が細胞の生育に必須ではない可能性を見いだした。本研究では、においてPolBタンパク質のDNA複製機構以外に果たす役割を解明することにより、超好熱性アーキアのDNA複製機構に新たな知見を得ることを目的とした。今回、
遺伝子の完全破壊株の作製に成功した(株)。この株について17時間培養した菌体に、紫外線,メチルメタンスルホン酸,マイトマイシンC, 線といったDNA損傷ストレスを与えた後、固形培地上で培養した。その結果、親株に比して株は、試みたすべてのDNA損傷ストレスに対して高感受性を示した。この結果から、PolBタンパク質は、の細胞の生育には必須ではないが、DNA修復機構に深く関与していることが示唆された。
DNAポリメラーゼB遺伝子破壊株のDNA損傷ストレス感受性の解析櫛田 卓志*; 鳴海 一成; 藤原 伸介*; 今中 忠行*; 東端 啓貴*
no journal, ,
超好熱性アーキアには、ファミリーB型とファミリーD型の2種類のDNAポリメラーゼの遺伝子がそれぞれ1つずつ見いだされている。ファミリーB型のポリメラーゼPolBは、高いDNA伸長能と正確性を持つなどの特徴から、DNA複製に必須なポリメラーゼで、おもにリーディング鎖の合成を担っていると考えられてきた。しかし、完全遺伝子破壊株が作製できたことから、PolBが細胞の生育に必須ではなく、果たしてDNA複製に必須なのかどうかが疑問視され始めている。本研究では、当該遺伝子の破壊株のDNA損傷ストレスに対する感受性を解析し、のPolBの機能を推定することを目的とした。その結果、遺伝子破壊株が野生株に比べてさまざまな変異原に感受性を示したことから、PolBはDNA修復に重要な役割を果たしていることが示唆された。
櫛田 卓志*; 鳴海 一成; 藤原 伸介*; 今中 忠行*; 東端 啓貴*
no journal, ,
の遺伝子について解析を進める過程で、ポリメラーゼドメインの保存領域を欠失した変異株を取得し、PolBタンパク質が細胞の生育に必須ではない可能性を見いだした。そこで、においてPolBタンパク質のDNA複製機構以外に果たす役割を解明することにより、超好熱性アーキアのDNA複製機構に新たな知見を得ることとした。今回、遺伝子の完全破壊株の作製に成功した(
株)。この株について17時間培養した菌体に、紫外線,メチルメタンスルホン酸,マイトマイシンC, 線といったDNA損傷を与えた後、固形培地上で培養した。その結果、親株に比べて株は、試みたすべてのDNA損傷に対して高感受性を示した。この結果から、PolBタンパク質は、の細胞の生育には必須ではないが、DNA修復機構に深く関与していることが強く示唆された。
由来DNAポリメラーゼBのDNA修復における役割東端 啓貴*; 櫛田 卓志*; 鳴海 一成; 今中 忠行*; 藤原 伸介*
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超好熱性アーキアには、ファミリーB型とファミリーD型の2種類のDNAポリメラーゼの遺伝子が、それぞれ1つずつ見いだされている。ファミリーB型のポリメラーゼPolBは、高いDNA伸長能と正確性を持つなどの特徴から、DNA複製に必須なポリメラーゼで、おもにリーディング鎖の合成を担っていると考えられてきた。しかし、完全遺伝子破壊株が作製できたことから、PolBが細胞の生育に必須ではなく、DNA複製に必須なのかどうかが疑問視され始めている。本研究では、当該遺伝子の破壊株のDNA損傷ストレスに対する感受性を解析し、
のPolBの機能を推定することを目的とした。その結果、野生株と比較して、遺伝子破壊株はさまざまな変異原に感受性を示した、このことから、PolBはDNA修復に重要な役割を果たしていることが強く示唆された。
の遺伝子破壊株の表現型解析櫛田 卓志*; 鳴海 一成; 藤原 伸介*; 今中 忠行*; 東端 啓貴*
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超好熱性アーキアの遺伝子破壊株の作製に成功し、DNA polymerase Bが当該微生物の生育に必須ではないことを発見した。また、この遺伝子破壊株はDNA損傷ストレスに対して高い感受性を示したことから、従来考えられていたDNA複製型polymeraseではなく、DNA修復型polymeraseであると強く示唆されている。一方、DNAは熱によっても不安定化し、化学的分解が促進される。例えば、脱プリン化に起因する鎖切断などがあげられ、熱によるDNA損傷も、最終的にはDNA polymeraseを含めた修復タンパク質による修復を受けると推測される。そこで現在、至適温度以上の高温条件における遺伝子破壊株の表現型解析を進めている。