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論文

Behavior of intermolecular interactions in $$alpha$$-glycine under high pressure

篠崎 彩子*; 小松 一生*; 鍵 裕之*; 藤本 千賀子*; 町田 真一*; 佐野 亜沙美; 服部 高典

Journal of Chemical Physics, 148(4), p.044507_1 - 044507_8, 2017/01

https://doi.org/10.1063/1.5009980
 被引用回数：9 パーセンタイル：42.42(Chemistry, Physical)

重水素化$$alpha$$-グリシンの結晶構造における圧力応答を、粉末および単結晶X線回折および高圧下での粉末中性子回折測定を用いて、室温で調べた。8.7GPaまでの相変化は観察されなかったが、格子圧縮率の異方性が見出された。中性子回折測定は、6.4GPaまでの圧縮で、$$c$$軸に沿った分子間D$$cdots$$O結合の距離が増大することを示した。$$a$$軸に沿った他のD$$cdots$$O結合の距離は圧力が増加するにつれて減少し、3GPa以上では最短の分子間水素結合となった。対照的に、$$b$$軸に沿った$$alpha$$-グリシン分子層間に形成された分岐したN-D$$cdots$$OおよびC-D$$cdots$$O水素結合の長さは、圧力が増加するにつれて著しく減少した。分子間距離の減少は、他の2つの軸と比較して、$$b$$軸の最大圧縮率をもたらした。Hirshfeld分析は、強固なN-D$$cdots$$O水素結合の収縮というよりも空隙領域の縮小で圧縮が起こることを示唆した

論文

Crystal structure of magnesium dichloride decahydrate determined by X-ray and neutron diffraction under high pressure

小松 一生*; 篠崎 彩子*; 町田 真一*; 松林 拓人*; 渡邉 真央*; 鍵 裕之*; 佐野 亜沙美; 服部 高典

Acta Crystallographica Section B; Structural Science, Crystal Engineering and Materials (Internet), 71(1), p.74 - 80, 2015/02

https://doi.org/10.1107/S205252061500027X
 被引用回数：19 パーセンタイル：79.64(Chemistry, Multidisciplinary)

MgCl$$_{2}$$水和物(MgCl$$_{2}$$10H$$_{2}$$O)とその重水素化物の結晶構造を、放射光X線とパルス中性子回折により初めて決定した。低温下においてまずアモルファス相を生成し、そのアモルファス相から固体-固体相転移により新規MgCl$$_{2}$$水和物を結晶化させることで良質な粉末結晶を得ることに成功した。最近開発された自動指数付けプログラムとcharge-flipping法により、(MgCl$$_{2}$$10H$$_{2}$$O)の結晶構造はMg(H$$_{2}$$O)$$_{6}$$八面体がABCABC...と積層したものであることが明らかになった。他の類似MgCl$$_{2}$$水和物と同様に、Clイオンと水分子は八面体のMg$$^{2+}$$イオンとは結合していない。2.5GPaにおいて差フーリエ解析により求められた重水素の位置は、他のMgCl$$_{2}$$水和物とは異なり、2つの酸素と二股状に結合している。

口頭

${it In vitro}$ screening of target kinases of AtATR

坂本 綾子; 根本 圭一郎*; 関 原明*; 篠崎 一雄*; 澤崎 達也*

no journal, , 

ATR protein is a conserved member of phosphatidylinositol 3-kinase-related kinases involved in cell-cycle checkpoint responses. ATR is activated through DNA damage or stalled replication fork and subsequently phosphorylates downstream cell-cycle components to inhibit the progression of cell cycle. In Arabidopsis, ATR-disrupted mutant shows hypersensitive to DNA damaging treatments or replication inhibitors. However, either upstream or downstream signaling cascade of ATR largely remains unknown in plants. To identify downstream components involved in the ATR-mediated checkpoint responses, we screened Riken Arabidopsis Full-Length (RAFL) cDNA clones by using AlphaScreen luminescence system. Here, the AtATR protein with GST-FLAG tag was synthesized in wheat cell-free extract using synthesized mRNA transcribed ${it in vitro}$, which is bound to protein A-conjugated acceptor beads through anti-FLAG antibody. Similarly, biotin-tagged putative kinases derived from RAFL cDNA clones were synthesized ${it in vitro}$ and bound to streptavidin-coated donor beads. When interaction between AtATR and a putative kinase happens, 520-620 nm emission light from acceptor bead induced by a singlet oxygen from donor bead becomes measurable. After screening of 759 clones, some candidate kinases showed higher luminescence signal than background level, indicating that they have protein-protein interactions with ATR.

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