Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
Initialising ...
sp. strain TCA20, isolated from a hot spring containing a high concentration of calcium ions藤浪 俊*; 武田 喜代子*; 小野寺 威文*; 佐藤 勝也; 佐野 元彦*; 高橋 優嘉*; 鳴海 一成*; 伊藤 政博*
Genome Announcements (Internet), 2(5), p.e00866-14_1 - e00866-14_2, 2014/09
Calcium-dependent
sp. strain TCA20 was isolated from a water sample of a hot spring containing a high concentration of calcium ions. Here, we report the draft genome sequence of this bacterium, which may be the basis for the research of calcium ion homeostasis. The draft genome sequence of
sp. strain TCA20 totals 5,631,463 bp in length and is composed of 33 large contigs (
500 bp) that was deposited at DDBJ/EMBL/Genbank under the accession no. BBIW00000000. The annotation of the draft genome sequence shows that
sp. strain TCA20 has a calcium-specific calcium/proton antiporter, ChaA, and a P-type calcium-transporting ATPase, YloB, was identified as calcium transporters. These transporters may also be important for the growth of
sp. strain TCA20 under the high concentration of calcium ions.
sp. TCA20株の生理化学的性質とゲノム解析今澤 陸*; 藤浪 俊*; 高橋 優嘉*; 佐藤 勝也; 鳴海 一成*; 伊藤 政博*
no journal, ,
細胞の生育に大きく関与するCa
は、細胞内でその濃度が厳密に調節されている。しかし、原核生物の細胞内Ca
濃度の調節機構については、未だ不明な点が多い。本研究では、カルシウム含有量が高い弱アルカリ性温泉地から分離されたCa
を生育に要求する
sp. TCA20株を用いて、細胞内外のCa
サイクルの詳細を理解するために、ゲノム解析を行った。その結果、Ca
/H
アンチポーターをコードする
遺伝子およびP型Ca
-ATPaseをコードする
遺伝子のホモログを持つことから、これらの遺伝子群がCa
サイクルや生育に重要である可能性が示唆された。