Neutron diffraction study on the structure of rubredoxin from it Pyrococcus furiosus

ルブレドキシンの中性子結晶構造解析

栗原 和男; 田中 伊知朗; Adams, M. W. W.*; Jenney, F. E. Jr.*; Moiseeva, N.*; Bau, R.*; 新村 信雄

Kurihara, Kazuo; Tanaka, Ichiro; Adams, M. W. W.*; Jenney, F. E. Jr.*; Moiseeva, N.*; Bau, R.*; Niimura, Nobuo

生体物質中性子回折装置BIX-3(日本原子力研究所JRR-3M 1Gサイト)を用いてルブレドキシン(超好熱菌由来、分子量約6,000、鉄-硫黄タンパク質)の中性子構造解析を現在行っている。このタンパク質は熱安定性が高く、その安定性と立体構造の関係が注目されている。今回用いた結晶の大きさは2.02.01.0 mmであった。データはステップスキャン法で測定し、ステップ間隔は軸の周り0.3°とした。露出時間は1フレームにつき約60-77分であり、全体では正味約35日間測定を行った。この回折測定では、d=1.5Å付近まで(コンプリートネスは76.8%)回折点を検出することができた。構造の精密化では301個の水素原子を含めた。現在のところ、分解能=1.5ÅでR因子=24.0%, R-free因子=26.3%である。また40個の重水素原子と29個の水和水を決定している。

With the new single-crystal diffractometer BIX-3 at the JRR-3M reactor of JAERI, a single-crystal neutron diffraction analysis of the structure of the small protein rubredoxin from the hyperthermophile Pyrococcus furiosus is currently under way. Data were collected at room temperature up to a resolution of 1.5 intervals in and exposure times ranging from 60 to 77 minutes per frame. The completeness factor of the 1.5-. Included in the refinement are 301 hydrogen atoms and 40 deuterium atoms, and 29 water molecules were also identified. In the present model, the current value for R and R are 24.0 and 26.3 , respectively.