ゲノム配列にもとづくタンパク質機能予測

Protein function prediction based on genome sequence

由良 敬

Yura, Kei

ゲノム配列の決定は生物学に大きな影響をもたらす。ゲノム配列とはそのゲノムをもつ生物種の設計図であり、ゲノム配列を解読することで、その生物がどのようにして構成されているのかが理解できるからである。1995年にHaemophilus influenzaeの全ゲノムがはじめて決定された時点で、生物学者が直面した問題は、ゲノム配列がわかっても、残念ながらその中に何が書かれているのかがわからないということであった。それまでの遺伝学及び生化学の知見では、理解できない情報が厖大に存在する。これらの情報を従来と同じ遺伝学及び生化学の手法のみで解析していくのは不可能に近い。そこで脚光を浴びるようになったのが生命情報学である。本章では生命情報学の現状と未来を解説する。

Determination of genome sequences has massive impacts on biology. Genome sequence is a blueprint of the species, and analyses of genome sequence may uncover every components of the species. However, when a whole genome of Haemophilus influenzae was sequenced, biologists realized that one was not able to deduce biological information out of the sequence. The genome sequence is full of information that knowledge based on conventional genetics and molecular biology can retrieve. Bioinformatics is the field that find niche in this area. In this chapter, we will overview the current status and the future of bioinformatics.