MPI-2 support in heterogeneous computing environment using an SCore cluster system

SCore PCクラスタを用いた異機種計算機環境におけるMPI-2機能の実現

辻田 祐一*; 今村 俊幸*; 山岸 信寛*; 武宮 博*

Tsujita, Yuichi*; Imamura, Toshiyuki*; Yamagishi, Nobuhiro*; Takemiya, Hiroshi*

近年PCクラスタを利用した並列計算環境を構築することが注目されている。このPCクラスタにおいて複数のノードを意識することなく利用できるためにSCoreが開発され利用されている。われわれはこのSCoreに、すでに開発した異機種計算機間で利用可能なMPI通信ライブラリStampiを移植し、SCoreでは利用できなかったMPI-2に定められた動的プロセス生成機能とSCoreが稼動するPCクラスタと他の計算機とのMPI通信を可能にした。この移植したStampiについて、性能評価を行ったところ、十分な性能が得られることと、Stampi自身が持つ柔軟な通信基盤の有効性が確認できた。

An MPI library for heterogeneous computing environment, Stampi, has been implemented on an SCore cluster system to enable dynamic process creation defined in MPI-2 and MPI communication among multiple clusters. Objective of this implementation is realization of heterogeneous computing environment with an SCore PC cluster and other machines. Through performance measurement, sufficient performance has been achieved and effectiveness of our flexible implementation has been confirmed.