水環境試料からの効率的なDNA抽出方法の開発及びリアルタイムPCRによる細菌数の計測

Efficient DNA extraction method and estimation of bacterial number by real-time PCR from environmental water samples

浅野 貴博; 佐々木 祥人 ; 景山 幸二*; 吉川 英樹

Asano, Takahiro; Sasaki, Yoshito; Kageyama, Koji*; Yoshikawa, Hideki

深部地質環境において、微生物はその活動に伴い地層処分システムにおける重要な現象の一つである地下水の酸化還元状態の変化に影響を与えている。微生物影響による地下水の酸化還元状態を評価するためには、処分環境における微生物バイオマスをより正確に定量することが必要となっている。そこで、今回、分子生物学的手法の一つであるリアルタイムPCR法により、地下水中に生息する微生物の定量精度の向上を図るうえで効率的なDNA抽出方法を検討し、細菌数の測定を試みた。その結果、ドメイン・バクテリアのDNA濃度から大腸菌生菌数に換算する測定系の構築ができ、微生物バイオマスの定量化や定量精度の向上が可能となった。

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