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DNAの水和とダイナミクスの塩基配列依存性; DNA-タンパク質,DNA-低分子認識の理解に向けて

Sequence dependencies of DNA strucutural dynamics and hydration; Torwards understanding the molecular recognition of DNA

米谷 佳晃; 河野 秀俊

Yonetani, Yoshiteru; Kono, Hidetoshi

DNAの水和は、生命現象の根幹となる分子間相互作用の性質を理解するうえで重要である。近年、分子動力学シミュレーションにより、DNAのマイナーグルーブに現れる水和パターンに塩基配列依存性があること、また、水和水の挙動がDNAの構造揺らぎと密接に関係していることがわかってきた。本稿では、それらの知見について紹介するとともに、塩基配列によって異なる水和の性質がDNAとタンパク質,低分子の相互作用にどのように関連しているか議論する。

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