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Predictions of DNA-binding proteins and transcription factor targets in the yeast genome

酵母ゲノムにおけるDNA結合蛋白質の推定とそのターゲット配列の推定

Ngahu, A.*; 上野 卓哉*; Ahmad, S.*; 河野 秀俊; 皿井 明倫*

Ngahu, A.*; Ueno, Takuya*; Ahmad, S.*; Kono, Hidetoshi; Sarai, Akinori*

酵母ゲノムにおいて、DNA結合蛋白質を推定し、その推定したDNA結合蛋白質のターゲット配列をさらに推定した。これにより、どの遺伝子がどの遺伝子と関連があるか予測することができる。酵母の場合、約150のDNA結合蛋白質が推定された。同じターゲット配列を持つ遺伝子は、細胞周期の同時期に働くと考えられており、その産物である蛋白質は、お互いに相互作用する可能性が高い。これをもとに、蛋白質-蛋白質相互作用の推定に応用できる。

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