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Molecular dynamics simulations of small glycine-(H$$_{2}$$O)$$_{it n}$$ ($$n$$=2-7) clusters on semiempirical PM6 potential energy surfaces

半経験的PM6ポテンシャルを用いたグリシン-水クラスターの分子動力学シミュレーション

高柳 敏幸*; 吉川 武宏*; 柿崎 陽*; 志賀 基之; 立川 仁典*

Takayanagi, Toshiyuki*; Yoshikawa, Takehiro*; Kakizaki, Akira*; Shiga, Motoyuki; Tachikawa, Masanori*

半経験的分子軌道法であるPM6法に基づいた分子動力学法により、グリシン-水クラスターの熱力学的構造を調べた。クラスターサイズが大きくなるにつれグリシンが中性分子であるよりも双性イオンであるほうが安定になる傾向が見られた。また、中性分子と双性イオンの形での水和構造の違いについて議論する。

Molecular dynamics simulations based on semiempirical PM6 method was carried out to study statistical structures of glycine-water clusters. We found that zwitterionic form is more stable than neutral form as the cluster size increases. The difference in water solvation structures around the neutral or zwitterionic glycine form is also discussed.

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