Parrallel molecular dynamics simulation on elastic properties of solid argon

固体アルゴンの弾性に関する並列分子動力学シミュレーション

清水 大志 ; 君塚 肇*; 蕪木 英雄; Li, J.*; Yip, S.*

Shimizu, Futoshi; Kimizuka, Hajime*; Kaburaki, Hideo; Li, J.*; Yip, S.*

並列分子動力学(MD)について、さまざまな並列化手法やカットオフを用いた計算の効率化手法を組み合わせたシミュレーションをプログラムするのは簡単ではない。われわれは大規模な並列MDシミュレーションのためのプログラムの基本パターンである「並列分子動力学ステンシル」を開発した。本ステンシルは並列化手法や効率化手法を分離し、プログラム作成者がシミュレーション自体に専念できるように設計されている。プログラムの全体はC言語とMPIを用いるが、各MPI関数の呼び出しはプログラム作成者から隠蔽されている。本論文では並列MDステンシルを用い15~75Kの固体アルゴン(結晶状態及びアモルファス状態)に関して500~1,000,000原子を用いたシミュレーションを行い、その弾性について研究した。

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