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Crystallization and preliminary neutron diffraction studies of HIV-1 protease cocrystallized with inhibitor KNI-272

HIV-1プロテアーゼとKNI-272との複合体の結晶化及び予備的中性子結晶構造解析

松村 浩由*; 安達 基泰; 杉山 成*; 岡田 詩乃*; 山上 恵*; 玉田 太郎; 日高 興士*; 林 良雄*; 木村 徹*; 木曽 良明*; 北谷 友也*; 牧 祥*; 吉川 洋史*; 安達 宏昭*; 高野 和文*; 村上 聡*; 井上 豪*; 黒木 良太; 森 勇介*

Matsumura, Hiroyoshi*; Adachi, Motoyasu; Sugiyama, Shigeru*; Okada, Shino*; Yamakami, Megumi*; Tamada, Taro; Hidaka, Koshi*; Hayashi, Yoshio*; Kimura, Toru*; Kiso, Yoshiaki*; Kitatani, Tomoya*; Maki, Sho*; Yoshikawa, Hiroshi*; Adachi, Hiroaki*; Takano, Kazufumi*; Murakami, Satoshi*; Inoue, Tsuyoshi*; Kuroki, Ryota; Mori, Yusuke*

本論文では、HIV-1プロテアーゼと薬剤候補分子であるKNI-272との複合体の結晶化と予備的中性子結晶構造解析について報告する。この中性子回折研究の目的は、水素原子の構造情報を得ることと活性中心の2つのアミノ酸残基の解離状態を決定することである。結晶化は、2液法を除冷法を組合せて、さらにマクロシーディングを繰り返し、1.4mm$$^{3}$$のサイズの結晶を得た。中性子回折データは、原子力機構のJRR-3に設置してあるBIX-4を用いて室温にて行った。回折データの分解能2.3${AA}$、空間群はP2(1)2(1)2、格子定数は、a=59.5, b=87.4, c=46.8${AA}$であった。

This paper reports the crystallization and preliminary neutron diffraction measurements of HIV-1 protease, a potential target for anti-HIV therapy, complexed with an inhibitor (KNI-272). The aim of this neutron diffraction study is to obtain structural information about the H atoms and to determine the protonation states of the residues within the active site. The crystal was grown to a size of 1.4 mm$$^{3}$$ by repeated macroseeding and a slow-cooling method using a two-liquid system. Neutron diffraction data were collected at room temperature using a BIX-4 diffractometer at the JRR-3 research reactor of the Japan Atomic Energy Agency (JAEA). The data set was integrated and scaled to 2.3 ${AA}$ resolution in space group P2(1)2(1)2, with unit-cell parameters a = 59.5, b = 87.4, c = 46.8 ${AA}$.

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分野:Biochemical Research Methods

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