X-ray absorption spectra of nucleotides (AMP, GMP, and CMP) in liquid water solutions near the nitrogen K-edge

水溶液中のヌクレオチド(AMP, GMP及びCMP)の窒素K吸収端近傍におけるX線吸収スペクトル

鵜飼 正敏*; 横谷 明徳; 藤井 健太郎; 斎藤 祐児  

Ukai, Masatoshi*; Yokoya, Akinari; Fujii, Kentaro; Saito, Yuji

ヌクレオチド(adenosine-5'-monophosphate, guanosine-5'-monophosophate, and cytidine-5'-monophosophate)の水溶液及び薄膜試料に対して、"水の窓"領域である窒素K吸収端近傍のX線吸収スペクトルを測定した。観測されたそれぞれのスペクトルは、ヌクレオチド分子中の核酸塩基残基部位の選択的励起を反映するため、核酸塩基に対する吸収と似たスペクトルを示した。窒素1s*共鳴領域では、それぞれのヌクレオチドについて、新しいピークが観測された。しかし水溶液試料と薄膜試料のそれぞれのスペクトルの間に明確な差はなく、塩基残基の疎水的な性質により水との相互作用の効果が小さいためであると推測された。

The X-ray absorption of nucleotides (adenosine-5'-monophosphate, guanosine-5'-monophosophate, and cytidine-5'-monophosophate) are measured in both water solutions and thin solid films at X-ray energies near the nitrogen K-edge in the "water-window" region. Each spectrum corresponds to the selective excitation of a nucleobase site in a nucleotide, and thus has features similar to the spectrum of the corresponding nucleobase. An additional new peak in the energy region of the nitrogen 1s* resonance is observed for each nucleotide. No significant difference between the water solutions and thin solid films is found, which might be attributable to the hydrophobic properties of a nucleobase in a nucleotide.