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${it Deinococcus aerius}$ sp. nov., isolated from the high atmosphere

高度大気圏から分離されたデイノコッカス・アエリウス

Yang, Y.*; 伊藤 隆*; 横堀 伸一*; 板橋 志保*; 島田 治男*; 佐藤 勝也; 大庭 寛史; 鳴海 一成; 山岸 明彦*

Yang, Y.*; Ito, Takashi*; Yokobori, Shinichi*; Itahashi, Shiho*; Shimada, Haruo*; Sato, Katsuya; Oba, Hirofumi; Narumi, Issei; Yamagishi, Akihiko*

日本の高度大気圏で収集した塵から、橙色の色素を持ち運動性のない球菌TR0125株が分離された。16S rRNA遺伝子をもとにした系統解析によってこの菌はデイノコッカス属細菌であることが示された。強い乾燥耐性,UV耐性,$$gamma$$線耐性及び高いGC含量は、この菌株がデイノコッカス属細菌であることを支持している。TR0125株は、デイノコッカス・アパチェンシスの標準菌株の16S rRNA遺伝子配列と最も高い類似性(95.7%)をもち、系統解析の結果は、TR0125株が、デイノコッカス・ジオサーマリス以上に、デイノコッカス・アパチェンシスと進化的に離れていることを示しており、このことは、TR0125株がこれら2種のデイノコッカス属細菌に属するものではないことを表している。他にも、TR0125株と上記2種のデイノコッカス属細菌の標準菌株との間には、幾つかの表現型に違いがあった。よって、われわれは今回分離した菌株に適合するものとして、新種デイノコッカス・アエリウスという名前を提案する。

An orange pigmented, non-motile, coccoid bacterial strain, TR0125, was isolated from dust samples collected in the high atmosphere above Japan. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that it was within the radiation of ${it Deinococcus}$ species. Major peptidoglycan amino acids were D-glutamic acid, glycine, D-alanine, L-alanine and ornithine. Predominant fatty acids were 17:0 iso, iso 17:1 $$omega$$ 9c and 15:0 iso. Strong resistance to desiccation, UV-C and $$gamma$$-radiation, high DNA G+C content also supported the affiliation of strain TR0125$$^{T}$$ to the genus ${it Deinococcus}$. TR0125$$^{T}$$ had a highest similarity value (95.7 %) of the 16S rRNA gene sequence to the type strain of the species ${it D. apachensis}$, and phylogenetic analysis shows that it was further separated from ${it D. apachensis}$ than from ${it D. geothermalis}$, indicating that strain TR0125$$^{T}$$ was not a member of these two ${it Deinococcus}$ species. Besides, there were phenotypic differences between strain TR0125$$^{T}$$ and type strains of the two species. Therefore, we propose a new species of the genus ${it Deinococcus}$, ${it Deinococcus aerius}$ sp. nov. (type strain, TR0125$$^{T}$$ = JCM 11750$$^{T}$$ = DSM 21212$$^{T}$$), to accommodate this isolate.

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パーセンタイル:40.8

分野:Microbiology

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